Protein–RNA interactions for Protein: P61809

Cdk5r1, Cyclin-dependent kinase 5 activator 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r1P61809 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdk5r1P61809 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdk5r1P61809 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms