Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smg6P61406 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smg6P61406 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms