Protein–RNA interactions for Protein: P60897

Sem1, 26S proteasome complex subunit SEM1, mousemouse

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sem1P60897 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sem1P60897 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sem1P60897 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.6 ms