Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap25P60879 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Snap25P60879 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Snap25P60879 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms