Protein–RNA interactions for Protein: P60843

Eif4a1, Eukaryotic initiation factor 4A-I, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif4a1P60843 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Eif4a1P60843 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Eif4a1P60843 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms