Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rin3P59729 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rin3P59729 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms