Protein–RNA interactions for Protein: P59470

Polr3b, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC2, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3bP59470 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Polr3bP59470 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Polr3bP59470 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms