Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dpf3P58269 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dpf3P58269 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dpf3P58269 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dpf3P58269 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dpf3P58269 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dpf3P58269 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Dpf3P58269 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms