Protein–RNA interactions for Protein: P57791

Rce1, CAAX prenyl protease 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rce1P57791 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rce1P57791 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms