Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp25P57080 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp25P57080 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp25P57080 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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