Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bace1P56818 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Bace1P56818 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Bace1P56818 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms