Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pdcd5P56812 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.9 ms