Protein–RNA interactions for Protein: P56563

Lim2, Lens fiber membrane intrinsic protein, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lim2P56563 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lim2P56563 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms