Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RabggtbP53612 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RabggtbP53612 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms