Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Efnb1P52795 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Efnb1P52795 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms