Protein–RNA interactions for Protein: P51612

Xpc, DNA repair protein complementing XP-C cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 930 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XpcP51612 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
XpcP51612 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
XpcP51612 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
XpcP51612 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
XpcP51612 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
XpcP51612 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
XpcP51612 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
XpcP51612 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
XpcP51612 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
XpcP51612 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
XpcP51612 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms