Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxc13P50207 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxc13P50207 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms