Protein–RNA interactions for Protein: P50136

Bckdha, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhaP50136 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BckdhaP50136 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms