Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Epb42P49222 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms