Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Rbp3P49194 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Rbp3P49194 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms