Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TgfaP48030 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms