Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tnfsf4P43488 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf4P43488 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf4P43488 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tnfsf4P43488 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms