Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ItgavP43406 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ItgavP43406 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms