Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NodalP43021 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NodalP43021 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NodalP43021 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NodalP43021 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NodalP43021 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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