Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Chd1P40201 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd1P40201 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Chd1P40201 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Chd1P40201 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms