Protein–RNA interactions for Protein: P36536

Sar1a, GTP-binding protein SAR1a, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1aP36536 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sar1aP36536 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sar1aP36536 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms