Protein–RNA interactions for Protein: P35419

Tpo, Thyroid peroxidase, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpoP35419 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
TpoP35419 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
TpoP35419 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TpoP35419 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TpoP35419 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TpoP35419 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TpoP35419 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpoP35419 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpoP35419 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpoP35419 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TpoP35419 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms