Protein–RNA interactions for Protein: P35288

Rab23, Ras-related protein Rab-23, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab23P35288 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rab23P35288 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rab23P35288 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms