Protein–RNA interactions for Protein: P34152

Ptk2, Focal adhesion kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptk2P34152 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ptk2P34152 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptk2P34152 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms