Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Pola1P33609 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola1P33609 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Pola1P33609 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Pola1P33609 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Pola1P33609 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms