Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Cd28P31041 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd28P31041 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms