Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tacr1P30548 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tacr1P30548 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms