Protein–RNA interactions for Protein: P29268

Ctgf, Connective tissue growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtgfP29268 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CtgfP29268 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CtgfP29268 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CtgfP29268 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms