Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PrkcdP28867 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PrkcdP28867 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms