Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2afxP27661 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
H2afxP27661 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
H2afxP27661 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms