Protein–RNA interactions for Protein: P24699

Myf5, Myogenic factor 5, mousemouse

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Length 255 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf5P24699 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Myf5P24699 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Myf5P24699 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Myf5P24699 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms