Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PparaP23204 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PparaP23204 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PparaP23204 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PparaP23204 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PparaP23204 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PparaP23204 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PparaP23204 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PparaP23204 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PparaP23204 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms