Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc2P20801 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnc2P20801 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms