Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Hoxb9P20615 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb9P20615 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms