Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ifrd1P19182 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ifrd1P19182 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms