Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Tnnc1P19123 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tnnc1P19123 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms