Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PtpraP18052 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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PtpraP18052 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtpraP18052 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms