Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gabra6P16305 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gabra6P16305 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gabra6P16305 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gabra6P16305 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra6P16305 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra6P16305 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra6P16305 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra6P16305 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra6P16305 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gabra6P16305 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gabra6P16305 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms