Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rag1P15919 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rag1P15919 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms