Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nme1P15532 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nme1P15532 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms