Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SptbP15508 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
SptbP15508 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SptbP15508 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SptbP15508 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SptbP15508 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SptbP15508 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SptbP15508 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SptbP15508 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SptbP15508 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SptbP15508 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SptbP15508 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SptbP15508 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms