Protein–RNA interactions for Protein: P12657

Chrm1, Muscarinic acetylcholine receptor M1, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrm1P12657 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Tmem150cos-201ENSMUST00000143245 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Chrm1P12657 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Chrm1P12657 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.1 ms