Protein–RNA interactions for Protein: P11725

Otc, Ornithine carbamoyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtcP11725 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OtcP11725 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OtcP11725 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
OtcP11725 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtcP11725 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtcP11725 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtcP11725 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
OtcP11725 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
OtcP11725 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
OtcP11725 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
OtcP11725 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms