Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Egr1P08046 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Egr1P08046 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Egr1P08046 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms