Protein–RNA interactions for Protein: P06683

C9, Complement component C9, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9P06683 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C9P06683 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C9P06683 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9P06683 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9P06683 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9P06683 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9P06683 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
C9P06683 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
C9P06683 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
C9P06683 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
C9P06683 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P06683 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P06683 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P06683 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P06683 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
C9P06683 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms